초고교급 절망에 의한 인류사상 최대최악의 절망적 사건으로 인해 과거에 세계는 붕괴까지 몰렸다. 그런 절망으로 가득 찬 세계를 구하기 위해 미래기관이 결성되었다. 에노시마 준코를 쓰러뜨린 나에기 마코토 일행 78기생은 미래기관에 소속하게 되었다. 그래서 세계의 부흥을 위한 활동을 계속하지만, 나에기는 절망의 잔당을 감쌌다고 해서 반역죄로 추궁당하고 만다. 나에기의 처분을 위해 모인 미래기관 일동이었지만, 모노쿠마로 인해 감금되어 최후의 살인을 강요받는다. 팔에는 이상한 팔찌가 붙여져 일정 시간이 되면 수면약이 투여된다. 거기다 이 중에는 '배신자'가 존재해 미래기관을 죽이러 온다는 것이다. 살아 남기 위해서는, '배신자'를 찾아내 죽일 수밖에 없다. '학급재판'이라는 규칙이 존재하지 않는 '살인'. 죽이는가 죽는가, 극한상태의 데스게임에서 나에기 일행은 궁지에 몰려간다. 희망이 희망을 죽이는 절망의 이야기가 시작된다.